Publications

• Tarlachkov S.V., Kudryakova I.V., Afoshin A.S., Tutukina M.N., Leontyevskaya E.A., Vasilyeva N.V. Draft genome sequence of the type strain Lysobacter capsici VKM B-2533 // Microbiology Resource Announcements, 2021, 10(3), e01194-20, PMID 33478995, DOI 10.1128/MRA.01194-20.
• Tarlachkov S.V., Starodumova I.P., Dorofeeva L.V., Prisyazhnaya N.V., Leyn S.A., Zlamal J.E., Albu S., Nadler S.A., Subbotin S.A., Evtushenko L.I. Draft genome sequences of 13 plant-associated actinobacteria of the family Microbacteriaceae // Microbiology Resource Announcements, 2020, 9(38), e00795-20, PMID 32943566, DOI 10.1128/MRA.00795-20.
• Rudenko T.S., Tarlachkov S.V., Shatskiy N.D., Grabovich M.Yu. Comparative genomics of Beggiatoa leptomitoformis strains D-401 and D-402^T with contrasting physiology but extremely high level of genomic identity // MDPI Microorganisms, 2020, 8(6), E928, PMID 32575621, DOI 10.3390/microorganisms8060928.
• Свиридов А.В., Шушкова Т.В., Эпиктетов Д.О., Тарлачков С.В., Ермакова И.Т., Леонтьевский А.А. Биодеградация фосфорорганических загрязнителей почвенными бактериями: биохимические аспекты и нерешенные проблемы // Биотехнология, 2020, 36(4), eLIBRARY 43798242, DOI 10.21519/0234-2758-2020-36-4-126-135.
• Tarlachkov S.V., Starodumov I.P., Dorofeeva L.V., Prisyazhnaya N.V., Leyn S.A., Zlamal J.E., Elane M.L., Osterman A.L., Nadler S.A., Subbotin S.A., Evtushenko L.I. Complete and draft genome sequences of 12 plant-associated Rathayibacter strains of known and putative new species // Microbiology Resource Announcements, 2020, 9(22), e00316-20, PMID 32467269, DOI 10.1128/MRA.00316-20.

• Пиголева С.В., Захарченко Н.С., Фурс О.В., Тарлачков С.В., Фунтикова Т.В., Филонов А.Е., Ариповский А.В., Дьяченко О.В., Бурьянов Я.И., Шевчук Т.В. Влияние ассоциативных микроорганизмов на рост и устойчивость растений к ксенобиотикам и фитопатогенами // Прикладная биохимия и микробиология, 2020, 56(4), 390–400, eLIBRARY 42809925, DOI 10.31857/S0555109920040133.

  Pigoleva S.V., Zakharchenko N.S., Furs O.V., Tarlachkov S.V., Funtikova T.V., Filonov A.E., Aripovskii A.V., Dyachenko O.V., Buryanov Y.I., Shevchuk T.V. Effects of associative microorganisms on plant growth and resistance to xenobiotics and phytopathogens // Applied Biochemistry and Microbiology, 2020, 56(4), 473–482, DOI 10.1134/S0003683820040134.

• Tarlachkov S.V., Epiktetov D.O., Sviridov A.V., Shushkova T.V., Ermakova I.T., Leontievsky A.A. Draft genome sequence of glyphosate-degrading Achromobacter insolitus strain Kg 19 (VKM B-3295), isolated from agricultural soil // Microbiology Resource Announcements, 2020, 9(17), e00284-20, PMID 32327510, DOI 10.1128/MRA.00284-20.
• Doronina N.V., Shmareva M.N., Kaparullina E.N., Vasilenko O.V., Tarlachkov S.V., Trotsenko Yu.A. Reclassification of Methylarcula marina Doronina et al. 2000 as Paracoccus methylarcula nom. nov. // Microbiology, 2020, 89(2), 197–204, eLIBRARY 43268728, DOI 10.1134/S0026261720020034.
• Tarlachkov S.V., Shevchuk T.V., Montero-Calasanz M.D.C, Starodumova I.P. Diversity of rhodopsins in cultivated bacteria of the family Geodermatophilaceae associated with non-aquatic environments // Bioinformatics, 2019, btz840, PMID 31711117, DOI 10.1093/bioinformatics/btz840.
• Lobastova T.G., Fokina V.V., Bragin E.Y., Shtratnikova V.Y., Starodumova I.P., Tarlachkov S.V., Donova M.V. Draft genome sequence of the moderately thermophilic actinobacterial steroid-transforming Saccharopolyspora hirsuta subsp. hirsuta strain VKM Ac-666^T // Microbiology Resource Announcements, 2020, 9(1), e01327-19, PMID 31896645, DOI 10.1128/MRA.01327-19.
• Poshekhontseva V.Y., Bragin E.Y., Fokina V.V., Shtratnikova V.Y., Starodumova I.P., Tarlachkov S.V., Donova M.V. Draft genome sequence of FK506-producing Streptomyces tsukubensis strain VKM Ac-2618D // Microbiology Resource Announcements, 2019, 8(24), e00510-19, PMID 31196928, DOI 10.1128/MRA.00510-19.
• Vasilenko O.V., Starodumova I.P., Dorofeeva L.V., Tarlachkov S.V., Prisyazhnaya N.V., Chizhov V.N., Subbotin S.A., Huntemann M., Clum A., Duffy K., Pillay M., Palaniappan K., Varghese N., Chen I.A., Stamatis D., Reddy T.B.K., O’Malley R., Daum C., Shapiro N., Ivanova N., Kyrpides N.C., Woyke T., Whitman W.B., Evtushenko L.I. Draft genome sequences of new isolates and the known species of the family Microbacteriaceae associated with plants // Microbiology Resource Announcements, 2018, 7(11), e01051-18, PMID 30533634, DOI 10.1128/MRA.01051-18.
• Orlova M.V., Tarlachkov S.V., Kulinchenko E.I., Dubinina G.A., Tutukina M.N., Grabovich M.Y. Genomics and biochemistry of metabolic pathways for the C₁ compounds utilization in colorless sulfur bacterium Beggiatoa leptomitoformis D-402 // Indian Journal of Microbiology, 2018, 58(4), 415–422, PMID 30262951, DOI 10.1007/s12088-018-0737-x.
• Fomenkov A., Sun Z., Vincze T., Dubinina G., Orlova M., Tarlachkov S.V., Anton B.P., Grabovich M.Y., Roberts R.J. Complete genome sequence of the freshwater bacterium Beggiatoa leptomitoformis strain D-401 // Genome Announcements, 2018, 6(17), e00311-18, PMID 29700149, DOI 10.1128/genomeA.00311-18.
• Dorofeeva L.V., Starodumova I.P., Krauzova V.I., Prisyazhnaya N.V., Vinokurova N.G., Lysanskaya V.Y., Tarlachkov S.V., Evtushenko L.I. Rathayibacter oskolensis sp. nov., a novel actinobacterium from Androsace koso-poljanskii Ovcz. (Primulaceae) endemic to the Central Russian Upland // IJSEM, 2018, 68(5), 1442–1447, PMID 29517475, DOI 10.1099/ijsem.0.002681.

• Шмарева М.Н., Доронина Н.В., Тарлачков С.В., Василенко О.В., Троценко Ю.А. Галоалкалофильный метилотроф Methylophaga muralis Bur 1, выделенный из содового озера Хилганта (Южное Забайкалье, Республика Бурятия) // Микробиология, 2018, 87(1), 23–36, eLIBRARY 32414213, DOI 10.7868/S0026365618010032.

  Shmareva M.N., Doronina N.V., Tarlachkov S.V., Vasilenko O.V., Trotsenko Yu.A. Methylophaga muralis Bur 1, a haloalkaliphilic methylotroph isolated from the Khilganta soda lake (Southern Transbaikalia, Buryat Republic) // Microbiology, 2018, 87(1), 33–46, DOI 10.1134/S0026261718010162.

• Tarlachkov S.V., Starodumova I.P. TaxonDC: calculating the similarity value of the 16S rRNA gene sequences of prokaryotes or ITS regions of fungi // Journal of Bioinformatics and Genomics, 2017, 3(5), DOI 10.18454/jbg.2017.3.5.1.
• Vasilenko O.V., Tarlachkov S.V., Starodumova I.P., Ariskina E.V., Ariskina K.I., Avtukh A.N., Lysak L.V., Telkov M.V., Evtushenko L.I. Draft Genome Sequence of Modestobacter sp. strain VKM Ac-2676 from soil in the area of sharply continental climate // BioRxiv, 2017, Preprint 179697, DOI 10.1101/179697.
• Starodumova I.P., Tarlachkov S.V., Prisyazhnaya N.V., Dorofeeva L.V., Ariskina E.V., Chizhov V.N., Subbotin S.A., Evtushenko L.I., Vasilenko O.V. Draft genome sequence of Rathayibacter sp. strain VKM Ac-2630 isolated from leaf gall induced by the knapweed nematode Mesoanguina picridis on Acroptilon repens // Genome Announcements. 2017, 5(30), e00650-17, PMID 28751392, DOI 10.1128/genomeA.00650-17.

• Аверин А.С., Косарский Л.С., Тарлачков С.В., Вехник В.А., Аверина И.В., Алексеев А.Е., Фесенко Е.Е., Накипова О.В. Влияние KB-R7943, ингибитора обратной формы Na⁺/Ca²⁺-обменного механизма, на силу сокращения папиллярных мышц сердца суслика Spermophilus undulatus // Биофизика, 2017, 62(1), 127-133, eLIBRARY 28805459.

  Averin A.S., Kosarsky L.S., Tarlachkov S.V., Vekhnik V.A., Averina I.V., Alekseev A.E., Fesenko E.E., Nakipova O.V. The effects of KB-R7943, an inhibitor of reverse Na⁺/Ca²⁺ exchange, on the force of contraction of papillary muscles in the heart of the ground squirrel Spermophilus undulates // Biophysics, 2017, 62(1), 109–114, DOI 10.1134/S000635091701002X.

• Trotsenko Y.A., Shmareva M.N., Doronina N.V., Tarlachkov S.V., Mustakhimov I.I., Vasilenko O.V. Draft genome sequence of Methylophaga muralis Bur 1, a haloalkaliphilic (non-methane-utilizing) methylotroph isolated from a soda lake // Genome Announcements, 2016, 4(6), e01227-16, PMID 27811106, DOI 10.1128/genomeA.01227-16.
• Orlova M.V., Tarlachkov S.V., Dubinina G.A., Belousova E.V., Tutukina M.N., Grabovich M.Y. Genomic insights into metabolic versatility of a lithotrophic sulfur-oxidizing diazotrophic alphaproteobacterium Azospirillum thiophilum // FEMS Microbiology Ecology, 2016, 92(12), fiw199, PMID 27660606, DOI 10.1093/femsec/fiw199.
• Vasilenko O.V., Doronina N.V., Shmareva M.N., Tarlachkov S.V., Trotsenko Y.A. Draft genome sequence of Methyloligella halotolerans C2^T, a new halotolerant methylotroph, accumulating poly-3-hydroxybutyrate and ectoine // Genome Announcements, 2016, 4(5), e01189-16, PMID 27789642, DOI 10.1128/genomeA.01189-16.

• Шевчук Т.В., Захарченко Н.С., Тарлачков С.В., Фурс О.В., Дьяченко О.В., Бурьянов Я.И. Метилирование промотора 35S в устойчивых к канамицину растениях каланхоэ (Kalanchoe pinnata L.), экспрессирующих трансген антимикробного пептида цекропина Р1 // Биохимия, 2016, 81(9), 1217–1221, eLIBRARY 27161730.

  Shevchuk T.V., Zakharchenko N.S., Tarlachkov S.V., Furs O.V., Dyachenko O.V., Buryanov Y.I. 35S Promoter methylation in kanamycin-resistant kalanchoe (Kalanchoe pinnata L.) plants expressing the antimicrobial peptide cecropin P1 transgene // Biochemistry (Moscow), 2016, 81(9), 968–971, PMID 27682168, DOI 10.1134/S0006297916090054.

• Vasilenko O.V., Starodumova I.P., Tarlachkov S.V., Dorofeeva L.V., Avtukh A.N., Evtushenko L.I. Draft genome sequence of "Rathayibacter tanaceti" strain VKM Ac-2596 from Tanacetum vulgare infested by a foliar nematode // Genome Announcements, 2016, 4(3), e00512-16, PMID 27313291, DOI 10.1128/genomeA.00512-16.
• Tarlachkov S.V., Dyachenko O.V., Cherevatenko A.M., Rudenko N.V., Shevchuk T.V. Cloning, purification and characterization of translationally fused protein DNA methyltransferase M•HhaI-EGFP // Process Biochemistry, 2014, 49(12), 2170–2173, DOI 10.1016/j.procbio.2014.09.016.

• Дьяченко О.В., Тарлачков С.В., Маринич Д.В., Шевчук Т.В., Бурьянов Я.И. Экспрессия экзогенных ДНК-метилтрансфераз: использование в молекулярной и клеточной биологии // Биохимия, 2014, 79(2), 115–127, eLIBRARY 21403444.

  Dyachenko O.V., Tarlachkov S.V., Marinitch D.V., Shevchuk T.V., Buryanov Y.I. Expression of exogenous DNA methyltransferases: application in molecular and cell biology // Biochemistry (Moscow), 2014, 79(2), 77–87, PMID 24794723, DOI 10.1134/S0006297914020011.

• Накипова О.В., Аверин А.С., Тарлачков С.В., Кокоз Ю.М. Действие агматина на ритмоинотропные явления в папиллярной мышце сердца зимоспящих животных // Доклады Академии Наук, 2013, 451(5), 581, DOI 10.7868/S0869565213240262.

  Nakipova O.V., Averin A.S., Tarlachkov S.V., Kokoz Y.M. The effect of agmatine on the rhythmoinotropic properties of the cardiac papillary muscle of hibernating animals // Doklady Biological Sciences, 2013, 451, 203–208, PMID 23975457, DOI 10.1134/S0012496613040121.

• Тарлачков С.В., Дьяченко О.В., Маринич Д.В., Шевчук Т.В. Особенности метилирования гена MDR1 при лейкозах. Новый подход к индуцированному CpG-метилированию генома для биологии и медицины // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А. Овчинникова, 2011, 7(4), 59–60, eLIBRARY 17767334.

• Аверин А.С., Захарова Н.М., Игнатьев Д.А., Тарлачков С.В., Накипова О.В. Влияние изопротеренола на сократимость папиллярных мышц сердца суслика // Биофизика, 2010, 55(5), 910–917, PMID 21033361.

  Averin A.S., Zakharova N.M., Ignat'ev D.A., Tarlachkov S.V., Nakipova O.V. Isoproterenol effects on the contractility of papillary muscles in the heart of ground squirrel // Biofizika, 2010, 55(5), 800–806, DOI 10.1134/S0006350910050210.

• Шевчук Т.В., Дьяченко О.В., Исмаилов Р.Г., Вологжанникова А.А., Тарлачков С.В., Бурьянов Я.И. Создание противоопухолевых препаратов на основе ингибиторов ДНК-цитозин(С5)-метилтрансфераз третьего поколения // Сибирский онкологический журнал, 2008, S1, 137.